动物的消化系统特别是肠内有上百种，数百亿的细菌形成肠内菌丛，它与动物健康有着密切的关系。肠内菌丛在发挥各种营养生理学作用的同时，纯正复合有机肥还可以抑制病原菌增殖等防御感染的作用。家畜的大肠菌症、沙门氏菌症以及梭状芽胞杆菌肠炎的发生都与肠内菌的状态有密切关系。因此，使肠内菌丛的平衡保持正常对维护动物健康是必不可少的。它与畜禽生产中的各项指标的提高和改善有密切关系。酒糟经过发酵其中含有大量的乳酸菌、酵母菌等多种有益微生物，作为饲料进入畜禽体内后，能迅速繁殖，一方面投入菌种的代谢物中和肠内毒素，复合有机肥生产抑制了其它有害菌丛的生长，另一方面在宿主体内形成了正常微生物菌群，为宿主合成主要的维生素，提供营养和阻止致病菌的入侵。

研究了添加酒糟的玉米秸秆饲料对肉用母牛怀孕最后3个月生长发育的影响。结果发现，与对照相比，饲喂含有酒糟饲料的母牛，复合有机肥生产身体条件更好;而且，产犊间隔、小牛出生体重和小牛断乳后体重也存在差异。酒糟饲料提高了母牛的身体条件，同时也不影响母牛的繁殖能力和小牛的生长发育。然而，也有报道指出，酒糟过多添加会影响动物的生长发育。发现用小麦酒糟饲喂断奶的小猪，如果酒糟添加量超过200 g/kg的话，湖南复合有机肥生产会显著降低断乳小猪的生长发育。虽然酿造乙醇后的酒糟蛋白质含量较高，但是，纤维含量高则限制了其添加量，同时，酒糟中的必需氨基酸含量较低，不能很好的满足动物生长的需求。

酒糟中有部分酒精残留。饲喂不当会导致鹅中毒。用酒糟喂鹅要注意以下事项：喂前应高温处理或晾晒，使酒精充分挥发。纯正复合有机肥生产喂量要适宜，不要超过日粮的5%。新鲜酒糟易发生酸变，可在酒糟中加入适量的石灰粉或小苏打，搅拌均匀，以中和酒糟中的酸。酒糟喂鹅要配合其他饲料，切忌单一饲喂。湖南复合有机肥生产酒糟中的能量、粗蛋白质含量低，且维生素A、维生素D和钙等营养物质缺乏，因此，必须搭配一定比例的玉米、饼粕类、糠麸等，同时还要搭配足量的青饲料，补充适量的骨粉。酒糟不可大量喂种鹅，否则会导致种公鹅精子畸形。

酒糟中含有丰富的粗蛋白和粗脂肪，是养鸡的好材料，但是酒糟处理不好营养难被吸收而且酒精含量高，不益于鸡的生长，纯正复合有机肥生产过量采食后还可能出现腹胀拉稀，食欲下降等不良症状。同时酒糟水分较大，容易变质滋生虫蝇不能长久保存，这是养殖户最为头疼的问题。想利用酒糟喂鸡，一般比较流行的方法是将酒糟用益生菌发酵剂发酵。现在发酵酒糟喂鸡，使用比较广泛的是农富康饲料发酵剂。农富康饲料发酵剂是一种由多种益生菌复合而成的高效微生物益生菌发酵剂，发酵过程是利用微生物菌的分解能力，湖南复合有机肥生产迅速的降解酒糟中的粗纤维，同时把酒糟料中残余的酒精和病毒、杂菌去除，延长酒糟存放时间。

啤酒糟相对更好一些，因为啤酒糟并不是真正的酒糟，啤酒糟是啤酒厂麦芽糖化工艺后，过滤所得到了滤渣，纯正复合有机肥里面还含有大量的残留的麦芽糖能量，以及大量的维生素和蛋白，营养含量极好，也正是因为营养好，所以，啤酒糟往往不能在露天存放太久，甚至超过一天就会味变质，所以，要及时压实发酵保存。白酒糟也是高粱酒糟，营养价值极低，几乎是没有能量的，能量都被酒厂发酵提取成为酒精了，复合有机肥生产剩下的只是蛋白营养，蛋白含量在10-20%左右，如果掺入了大量的谷壳的话，则营养更差，并且含有大量的醛酮酚等酒精发酵剩余物，对动物不利，所以，也需要进行处理，如果不发酵处理的话，可以选择太阳暴晒、或加生石灰4%左右中和后掺喂。

如果要长期保存发酵后的酒糟物料则要密封严格，并压紧压实处理，纯正复合有机肥生产尽量排出包装袋中的空气，这样不仅可以长期保存，而且在保存的过程中，发酵还在进行，时间较长后，消化吸收率更好，营养更佳。其他发酵的白酒糟渣也是这个原理，当然，湖南复合有机肥生产前提条件是能确保密封严格，不漏一点空气进入料中，则时间越长，质量更好，营养更佳（但实际生产中，很多用户并不能保证密封严格，所以，建议尽快用完为好）。